一、具交叉干涉的三点测交区间标记定位(QTL)的相关方法（论文文献综述）
张小小[1]（2006）在《对三点测交区间标记定位QTL的相关方法的理论探讨》文中研究指明QTL是数量性状基因位点（Quantitative trait loci）的英文缩写，是位于染色体的上影响数量性状的一些区域，利用特定的遗传标记可以确定某一性状的QTL在染色体上的数目、位置及其遗传效应，这就是QTL作图。单个基因的确定有很大的作用，可以提高育种选择的效率，特别是对低遗传力性状和限性性状而言；可以将转基因技术用于数量性状；在医学上可以鉴别由多因素引起的遗传疾病，为基因治疗和改进预防措施提供依据；对基因的数目和特性有所了解以后，有助于增进对育种及生物的进化的了解。 三点测交是基因连锁作图的经典方法，由于其实用性强，广泛地应用于基因定位的研究工作之中。但是目前的研究方法大都是在忽视交叉干涉的情形下得出的结果。本文运用极大似然方法，首先讨论了交叉干涉情形下的三点测交群体，得出了计算各参数的理论公式及方差估计，并对作图函数的选择作了说明，使基因连锁作图更准确。然后对三点测交区间标记定位（QTL）的相关方法进行了理论探讨，并结合相关方法得出了重组值的估计公式及重组值的抽样方差估计公式，实例表明所得公式是有一定实际意义的。
韩毅强[2]（2004）在《甘蓝型油菜磷营养高效基因的定位和分析》文中研究指明油菜是我国的主要油料作物，大约有50％的食用植物油来源于油菜，种植面积和总产均居世界首位。甘蓝型油菜对缺磷敏感，同时又存在广泛的基因型差异，遗传改良甘蓝型油菜的不良磷营养性状显得十分必要的。华中农业大学微量元素研究室收集了226个甘蓝型油菜品种，利用植物基因型间矿质元素吸收利用效率的差异，运用盆栽的方法对不同品种缺磷反应进行了筛选，获得典型的磷高效品种“97081”和磷低效品种“97009”，并在大田小区试验中得到进一步验证。本研究以“97081”为父本、“97009”为母本构建了F2：3家系群体，应用分子生物学技术，利用SSR、AFLP等分子标记构建遗传连锁图谱，定位磷营养高效基因，主要结果如下： 1．应用202个SSR、AFLP等多态性标记位点对F2：3群体作图，初步构建了甘蓝型油菜的分子标记连锁图谱，该图谱标记间平均间距9.66cM，覆盖了甘蓝型油菜基因组的1950.7cM。同时观察到较低频率的偏分离现象，比率为15.5％，在连锁群LG2和LG13存在一些偏分离热点区域，进一步讨论了偏分离存在的普遍性。 2．用单因子方差分析法在P＜0.01水平下共检测到45个相关性标记。其中在磷胁迫条件下发现的最多，有27个相关性标记，解释的表型变异方差为5.0％-10.9％，主要集中在LG11和LG12连锁群上。 3．通过复合区间作图法，对正常磷条件下、磷胁迫条件下及相对条件下的产量、株高、分枝数、第一分支高、地上部干重和千粒重等6个性状进行QTL定位。一共定位到28个QTL，单个QTL解释的表型变异方差在7.7％-59.2％之间；LG3、LG11和LG12连锁群上不同性状的QTL在置信区间内有较大的重叠区域，其中含有磷高效基因QTL dsy2、dsy3，最终确定dsy1、dsy2、dsy3和pec1为磷高效QTL。解释的表型变异方差分别为39.4％、37.5％、19.4％和41.4％。dsy1、dsy2和pec1是进一步工作的目标QTL。
李宏,王星敏,王瑞琪[3]（2003）在《分子区间标记定位QTL的一种改进方法——基于分子标记的极大似然法》文中指出提出了以区间分子标记定位QTL时,以分子标记各种类型的性状密度函数进行极大似然估计,进而获得LOD值的极大值,达到准确定位QTL的结果,并与原方法进行了比较。结果表明,新方法所得LOD的数字表达式更简单,并且可以看出样本容量n和分子标记的密度r对于maxELOD值的估计有很大影响。
李宏[4]（2002）在《数量性状基因座（QTL）定位的研究进展》文中研究说明对数量性状基因座 （QTL）的几种主要定位方法的统计学原理进行了综述 ,总结了每种方法的优缺点及其发展动态 ,特别是对新发展的多区间作图和多性状作图进行了较详细的介绍 ,并对目前存在的问题和今后的发展进行了讨论
李宏[5]（2001）在《具交叉干涉的三点测交区间标记定位（QTL）的相关方法》文中研究说明本文提出在有交又干涉条件下，在测交群体中对区间标记庄位赋值后求其与待定 位的数量性状表型值间的简单相关系数Ｒ，以此进行连锁测验，并且在一定条件下用Ｒ值求出 该数量性状座位（ＱＴＬ）与各标记座位（ＭＬ）间的重组值．
二、具交叉干涉的三点测交区间标记定位(QTL)的相关方法（论文开题报告）
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
三、具交叉干涉的三点测交区间标记定位(QTL)的相关方法（论文提纲范文）
（1）对三点测交区间标记定位QTL的相关方法的理论探讨（论文提纲范文）
| 摘要 |
| Abstract |
| 第一章 绪论 |
| 1.1 研究现状 |
| 1.2 研究思路 |
| 1.3 研究的目的和意义 |
| 第二章 预备知识 |
| 2.1 遗传学基本术语 |
| 2.2 减数分裂中真核生物的核基因传递规律 |
| 第三章 三点测交 |
| 3.1 三点测交的基本知识 |
| 3.2 三点测交遗传结构分析 |
| 3.3 Fisher信息测度的计算 |
| 3.4 交叉干涉情形下三点测交基因连锁作图函数的选择分析 |
| 3.5 本章小结 |
| 第四章 三点测交区间标记定位 QTL的相关方法 |
| 4.1 基本统计学原理 |
| 4.2 重组值的估计 |
| 4.3 连锁顺序的判断方法 |
| 4.4 例题分析 |
| 4.5 本章小结 |
| 总结与展望 |
| 参考文献 |
| 致谢 |
（2）甘蓝型油菜磷营养高效基因的定位和分析（论文提纲范文）
| 中文摘要 |
| ABSTRACT |
| 缩写语 |
| 1 文献综述 |
| 1.1 遗传图谱构建和基因定位 |
| 1.1.1 数量性状位点(QTL)定位的方法 |
| 1.1.1.1 单标记分析法(ONE MARKER ANALYSIS) |
| 1.1.1.2 区间作图法(INTEVAL MAPPING，IM) |
| 1.1.1.3 复合区间作图法(COMPOSITE INTERVAL MAPPING，CIM) |
| 1.1.2 油菜分子标记连锁图的构建和控制重要农艺性状基因的定位 |
| 1.1.3 磷利用相关性状的分析和定位 |
| 1.2 磷胁迫(饥饿)条件下基因的表达 |
| 1.2.1 磷转运子的基因及其表达调控 |
| 1.2.2 植物耐低磷的有机酸分泌 |
| 1.2.3 磷酸酶(APASE)基因 |
| 2 本研究的内容、目的和意义 |
| 3 材料和方法 |
| 3.1 作图群体构建 |
| 3.2 田间实验设计 |
| 3.3 群体单株基因型分析 |
| 3.3.1 DNA提取 |
| 3.3.2 SSR分析 |
| 3.3.3 AFLP分析 |
| 3.3.3.1 模板DNA的酶切与连接 |
| 3.3.3.2 预扩增和选择性扩增 |
| 3.3.3.3 电泳和染色 |
| 3.4 基因型记载 |
| 3.5 数据统计分析 |
| 3.5.1 田间数据分析 |
| 3.5.2 遗传图谱的构建 |
| 3.5.3 QTL定位和效应分析 |
| 3.6 偏分离统计分析 |
| 4 结果分析 |
| 4.1 田间数据处理分析 |
| 4.1.1 亲本差异分析 |
| 4.1.2 群体性状分析 |
| 4.2 作图亲本之间的遗传多样性评估 |
| 4.3 多态性标记的筛选、标记和连锁图谱的构建 |
| 4.4 QTL分析 |
| 4.4.1 单因子方差分析法对相关QTL的检测 |
| 4.4.2 复合区间作图分析 |
| 4.5 偏分离检测 |
| 5 讨论 |
| 5.1 偏分离现象的普遍性 |
| 5.2 QTL的真实性 |
| 5.3 磷高效基因 |
| 5.4 进行图位克隆的可行性 |
| 6 参考文献 |
| 致谢 |
| 附录Ⅰ |
| 附录Ⅱ |
| 附录Ⅲ |
（3）分子区间标记定位QTL的一种改进方法——基于分子标记的极大似然法（论文提纲范文）
| 1 Lander和Botstein的区间作图原理 |
| 2 基于分子标记的极大似然法 |
| 3 两种方法的比较和结论 |
（4）数量性状基因座（QTL）定位的研究进展（论文提纲范文）
| 1 分子遗传标记 |
| 2 QTL定位方法 |
| 2.1 均值-方差分析法 |
| 2.2 距法和最大似然法 |
| 2.3 相关分析法 |
| 2.4 区间作图法 |
| 2.5 复合区间作图法 |
| 2.6 多区间作图 |
| 2.6.1 MIM模型的似然函数 |
| 2.6.2 参数估计 |
| 2.6.3 QTL作图策略 |
| 2.7 多性状作图 |
| 3 总 结 |
四、具交叉干涉的三点测交区间标记定位(QTL)的相关方法（论文参考文献）
- [1]对三点测交区间标记定位QTL的相关方法的理论探讨[D]. 张小小. 暨南大学, 2006(06)
- [2]甘蓝型油菜磷营养高效基因的定位和分析[D]. 韩毅强. 华中农业大学, 2004(01)
- [3]分子区间标记定位QTL的一种改进方法——基于分子标记的极大似然法[J]. 李宏,王星敏,王瑞琪. 重庆工商大学学报(自然科学版), 2003(02)
- [4]数量性状基因座（QTL）定位的研究进展[J]. 李宏. 渝州大学学报(自然科学版), 2002(03)
- [5]具交叉干涉的三点测交区间标记定位（QTL）的相关方法[J]. 李宏. 生物数学学报, 2001(04)